第一：培養目標不同
MBA是培養能夠勝任工商企業和經濟管理部門高層管理工作需要的務實型、復合型和應用型高層次管理人才；
普通碩士是培養具有扎實理論基礎和較強的科研能力的高層次人才；
第二：培養對象不同
MBA的招生對象一般為大學本科或者大專畢業生，具有三年以上工作實踐經驗和國家機關事業單位干部和工商企業管理人員；
普通碩士可以招收應屆畢業生，也可以招收在職人員；
第三：培養方式不同
MBA本質上是一種職業訓練，通過商業案例分析、實戰觀摩、分析與決策技能訓練等培養學生的實際操作技能，更具有職業競爭的實力；
普通碩士側重于理論學習、學術研究；
第四：學費不同
MBA的學費一般要貴一些，便宜點10萬左右，好的學校可達40-50萬甚至百萬；
普通碩士的學費則普遍在1-3萬元左右；
第五：課程設置不同
MBA的課程側重于實踐類的科目；
普通碩士課程則側重于學術和研究；
第六：就業不同
MBA畢業后多為管理者，也包括企業高層，政府官員，自主創業等；
普通碩士根據自身所學方向，一般從基層做起居多；